Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSH3Q8TE77 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSH3Q8TE77 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSH3Q8TE77 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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