Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DTX3LQ8TDB6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DTX3LQ8TDB6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms