Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HJURPQ8NCD3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HJURPQ8NCD3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms