Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBR7Q8N806 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UBR7Q8N806 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms