Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSGALNACT2Q8N6G5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSGALNACT2Q8N6G5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms