Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT1

SCN4B, Sodium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4BQ8IWT1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCN4BQ8IWT1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCN4BQ8IWT1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms