Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC83Q8IWF9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC83Q8IWF9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms