Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARID3BQ8IVW6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARID3BQ8IVW6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms