Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNGA4Q8IV77 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CNGA4Q8IV77 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms