Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM139Q8IV31 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM139Q8IV31 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms