Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
DZIP3Q86Y13 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DZIP3Q86Y13 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms