Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7A3

CTU1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1Q7Z7A3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTU1Q7Z7A3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTU1Q7Z7A3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms