Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRAPQ7Z569 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BRAPQ7Z569 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms