Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTOP3Q7RTS5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
OTOP3Q7RTS5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OTOP3Q7RTS5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms