Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PDZD4Q76G19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDZD4Q76G19 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms