Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PAXIP1Q6ZW49 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAXIP1Q6ZW49 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms