Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GBP6Q6ZN66 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GBP6Q6ZN66 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms