Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNE3Q6ZMZ3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNE3Q6ZMZ3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms