Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CASC1Q6TDU7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CASC1Q6TDU7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms