Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SAMD1Q6SPF0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SAMD1Q6SPF0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms