Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED9Q6R2W3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED9Q6R2W3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms