Protein–RNA interactions for Protein: Q6P161

MRPL54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL54Q6P161 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MRPL54Q6P161 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms