Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3HQ6NTF7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3HQ6NTF7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms