Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GDF6Q6KF10 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GDF6Q6KF10 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GDF6Q6KF10 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms