Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 999 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MCTP1Q6DN14 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
MCTP1Q6DN14 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MCTP1Q6DN14 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
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