Protein–RNA interactions for Protein: Q68DV7

RNF43, E3 ubiquitin-protein ligase RNF43, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF43Q68DV7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF43Q68DV7 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF43Q68DV7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms