Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CREB3L3Q68CJ9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CREB3L3Q68CJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CREB3L3Q68CJ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms