Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCERG1LQ5VWI1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms