Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1orf53Q5VUE5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1orf53Q5VUE5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms