Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
C9orf135Q5VTT2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C9orf135Q5VTT2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms