Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR78Q5VTH9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR78Q5VTH9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR78Q5VTH9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms