Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CEP350Q5VT06 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CEP350Q5VT06 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CEP350Q5VT06 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms