Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGSNQ5TDP6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGSNQ5TDP6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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