Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P3

LCE1B, Late cornified envelope protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE1BQ5T7P3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LCE1BQ5T7P3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms