Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LDLRAD1Q5T700 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LDLRAD1Q5T700 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms