Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MARCH8Q5T0T0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MARCH8Q5T0T0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms