Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NHSL1Q5SYE7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NHSL1Q5SYE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms