Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSQ6

SAPCD1, Suppressor APC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAPCD1Q5SSQ6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SAPCD1Q5SSQ6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SAPCD1Q5SSQ6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms