Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRMS1LQ5PSV4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRMS1LQ5PSV4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms