Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
COLEC12Q5KU26 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COLEC12Q5KU26 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms