Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
XKR3Q5GH77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XKR3Q5GH77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms