Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ODF2Q5BJF6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ODF2Q5BJF6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms