Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PAN3Q58A45 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PAN3Q58A45 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms