Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGO2Q562F6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGO2Q562F6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms