Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ALFQ53S48 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms