Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CFAP221Q4G0U5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP221Q4G0U5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms