Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LONRF3Q496Y0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LONRF3Q496Y0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LONRF3Q496Y0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms