Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBS9Q3SYG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BBS9Q3SYG4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms