Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SP6Q3SY56 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SP6Q3SY56 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms