Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL38Q2WGJ6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms